请问，我提交工伤认定书后，某某去公司调查，

公司不配合人社局调查，你可直接申请工伤认定。
依据《工伤保险条例》，工伤职工有权在1年内直接向劳动保障行政部门提出工伤认定申请，公司不配合不影响你的权益。若不及时处理，可能导致工伤认定延迟，影响你获得应有的工伤赔偿。
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公司不配合，这样处理。
1. 尝试与公司协商，说明工伤情况，要求配合调查。
2. 若协商无果，整理相关证据，如工作记录、医疗证明等。
3. 向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查。
4. 必要时，提起劳动仲裁，通过法律途径确认劳动关系，进行工伤认定，并要求赔偿。
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公司不配合时，你可选择协商、投诉或仲裁。
首先尝试与公司协商，若协商无果，可搜集证据向劳动监察部门投诉，或提起劳动仲裁，以法律手段维护自身权益。